Пробиотики

Alistipes putredinis

Идентификация и таксономия

  • Полное научное название: Alistipes putredinis (вид), штаммы могут варьироваться (например, ATCC 25870); род Alistipes, семейство Rikenellaceae
  • Коллекционные номера: ATCC 25870, DSM 17216, CCUG 46048, LMG 18509
  • Класс бактерий: Грамотрицательные, строгие анаэробы
  • Генетические маркеры: Выявлены гены, участвующие в метаболизме триптофана (например, tnaA), производстве индола и короткоцепочечных жирных кислот (КЦЖК); отсутствуют известные гены классических бактериоцинов; обнаружены гены, потенциально участвующие в модуляции воспалительных реакций
  • Природный источник обитания: Толстый кишечник человека, преимущественно в просвете толстой кишки
  • Синонимы и устаревшие названия: Ранее классифицировался как часть Bacteroides-подобной флоры; не имеет значимых синонимов
  • Статус безопасности: Не имеет статуса GRAS (Generally Recognized As Safe, США) или QPS (Qualified Presumption of Safety, ЕС) в качестве пробиотика; в препаратах не зарегистрирован как отдельный штамм; в России официально не одобрен как компонент БАДов или лекарств

История открытия и исследований

Alistipes putredinis был впервые выделен в 1970-х годах из фекалий человека и классифицирован как строгий анаэроб, продуцирующий сероводород и обладающий характерным запахом гниения (отсюда название putredinis — от лат. putredo, гниль). Первоначально рассматривался как часть условно-патогенной микробиоты. В 2003 году вид был официально описан и выделен в род Alistipes на основе 16S рРНК-секвенирования.

На протяжении 2000-х годов A. putredinis считался маркером дисбиоза, особенно при воспалительных и метаболических состояниях. Однако с развитием метагеномики и функционального анализа микробиома в 2010–2020-х годах появились данные, указывающие на его возможную регуляторную роль в кишечной экосистеме.

Клинические исследования с участием A. putredinis как целенаправленного пробиотического штамма отсутствуют. Большинство данных получены из корреляционных исследований микробиома, анализа трансплантации фекальной микробиоты (ФГТ) и экспериментов на животных. Патенты на использование штаммов Alistipes в качестве модуляторов микробиоты находятся на стадии разработки, но не зарегистрированы в открытых базах как коммерческие продукты.

Механизм действия

Alistipes putredinis действует преимущественно через метаболическую активность, взаимодействуя с другими представителями микробиоты и хозяином косвенно.

  • Конкурентное исключение патогенов: Не является доминантным колонизатором, поэтому прямое вытеснение патогенов маловероятно. Однако может ограничивать рост некоторых бактерий за счёт потребления общих субстратов (например, белков и аминокислот).
  • Выработка метаболитов:
    • Производит индол и его производные (например, индолпропионовую кислоту) из триптофана — соединения с антиоксидантными и противовоспалительными свойствами.
    • Синтезирует ацетат и сукцинат (предшественник пропионата), участвующие в энергетическом обмене и регуляции иммунного ответа.
    • Не производит бактериоцины и витамины в значимых количествах.
  • Модуляция иммунитета: Индолы могут взаимодействовать с арил-углеводородным рецептором (AhR) на иммунных клетках, снижая продукцию провоспалительных цитокинов (IL-6, TNF-α). Также предполагается влияние на Treg-клетки и Th17-баланс.
  • Влияние на целостность кишечного барьера: Прямых доказательств воздействия на tight junctions нет. Косвенно — через снижение воспаления и модуляцию микробиоты — может способствовать улучшению барьерной функции.

Клинические показания

На данный момент A. putredinis не одобрен ни в одной стране в качестве пробиотического препарата. Все возможные применения остаются в области исследований.

Основные

  • Не одобрены

Исследуемые

  • Метаболический синдром и ожирение: В ряде исследований снижение уровня Alistipes коррелирует с ожирением и инсулинорезистентностью, но другие работы показывают противоположную тенденцию — возможна контекст-зависимая роль.
  • Депрессия и тревожные расстройства: A. putredinis активно изучается в контексте микробиота-кишечник-мозг-ось. Повышенные уровни ассоциируются с тревожностью и депрессией у людей, но у мышей его введение улучшало поведенческие показатели — противоречивые данные.
  • Воспалительные заболевания кишечника (ВЗК): Уровень A. putredinis снижается при язвенном колите, что может указывать на его потенциальную протективную роль.
  • Аутоиммунные состояния: Изучается в контексте рассеянного склероза и ревматоидного артрита как модулятор Th17/Treg-баланса.

Практическое применение: сценарии использования

Поскольку A. putredinis не представлен в коммерческих пробиотиках, его применение в клинической практике невозможно. Тем не менее, можно рассмотреть гипотетические сценарии на основе научных данных.

  • Сценарий 1: Хроническое воспаление и усталость
    Проблема: пациент с субклиническим воспалением, повышением С-реактивного белка, умеренной депрессией.
    Почему выбирают: штамм теоретически способствует выработке индолов, модулирующих воспаление и нейротрансмиссию.
    Ожидания: накопительный эффект в течение 6–12 недель; улучшение настроения и снижение усталости возможны только при комплексной коррекции микробиоты.
  • Сценарий 2: После ФГТ при ВЗК
    Проблема: стабилизация микробиоты после трансплантации.
    Почему выбирают: A. putredinis часто обогащается у доноров с хорошими клиническими исходами.
    Ожидания: поддержка ремиссии, но не как монотерапия, а в составе многокомпонентного подхода.
  • Сценарий 3: Метаболическая дисфункция
    Проблема: инсулинорезистентность, дисбиоз.
    Почему выбирают: потенциальная роль в регуляции энергетического обмена через метаболиты.
    Ожидания: умеренные изменения при длительном приёме, в сочетании с диетой и физической активностью.

Важно: пробиотики не заменяют основное лечение. Использование A. putredinis в будущем возможно только в составе многоштаммовых или персонализированных пробиотиков.

Схемы дозирования и формы выпуска

На данный момент Alistipes putredinis не выпускается в виде коммерческих пробиотических препаратов. Данные о дозировке отсутствуют.

Форма выпуска Концентрация (КОЕ/г или мл) Рекомендуемая доза Длительность курса Условия хранения
Не выпускается — — — —

Примечание: в экспериментальных исследованиях на животных используются дозы порядка 108–109 КОЕ/сутки, вводимые перорально. Условия хранения требуют строгой анаэробности, заморозки при −80 °C, что делает пероральный приём в обычных формах (капсулы, порошки) технически сложным.

Побочные эффекты и реакция Герксхаймера

Прямых данных о побочных эффектах при приёме A. putredinis нет, так как он не применяется как пробиотик. Однако на основе свойств рода Alistipes можно предположить возможные реакции.

  • Вздутие, газообразование, изменение стула — возможны при резком увеличении количества анаэробов.
  • Повышение уровня индолов — при избытке может оказывать нейротоксическое действие, особенно при нарушении функции печени или почек.
  • Реакция Герксхаймера (усиление симптомов при гибели микробов) не описана, но теоретически возможна при массовой модуляции микробиоты.

Практические стратегии минимизации

  • Титрование дозы: при будущем использовании рекомендовано начинать с низких доз (например, 106–107 КОЕ/сутки) с постепенным увеличением.
  • При усилении симптомов: снизить дозу или временно прекратить приём; оценить наличие СИБР (синдром избыточного бактериального роста в тонкой кишке).
  • Когда прекратить приём: при появлении стойкого вздутия, диареи, признаков системного воспаления (лихорадка, ухудшение самочувствия), особенно у лиц с иммунодефицитом.

Противопоказания и предостережения

  • Абсолютные: тяжелый иммунодефицит (включая ВИЧ с низким CD4, после трансплантации органов), синдром короткой кишки, острый панкреатит, нарушение целостности кишечного барьера (например, при тяжелом колите).
  • Относительные: СИБР, хроническая почечная недостаточность (из-за риска накопления индолов), психические расстройства (ввиду двойственной роли в нейромодуляции).
  • Особые группы: безопасность при беременности, лактации и у детей до 3 лет не изучена. Не рекомендуется к применению в этих группах.

Аналоги и синергисты

Поскольку A. putredinis не является классическим пробиотиком, прямых аналогов нет. Однако можно выделить функционально схожие или комплементарные штаммы.

Организм Зона действия Устойчивость к желудочному соку и желчи Доказательная база (РКИ) Возможность совместного приёма
Akkermansia muciniphila (лиофилизированная) Слизистый слой толстой кишки Умеренная (требует защиты) Более 20 РКИ у людей Возможен — оба участвуют в барьерной функции
Faecalibacterium prausnitzii Просвет толстой кишки Низкая (строгий анаэроб) Ограниченные данные, в основном пре- и клиника Теоретически синергичны (оба производят противовоспалительные метаболиты)
Bacteroides thetaiotaomicron Толстый кишечник Низкая Много пре-клинических данных Возможен — оба участвуют в расщеплении сложных субстратов
Lactobacillus reuteri DSM 17938 Тонкий кишечник, желудок Высокая Более 50 РКИ Возможен — разные зоны действия, низкая конкуренция

Питание и пребиотики на фоне приёма

Для поддержки колонизации A. putredinis (в случае его будущего применения) рекомендуются диеты, богатые белками и аминокислотами, особенно триптофаном, а также сложными растительными волокнами.

  • Предпочтительные волокна: инулин, фруктоолигосахариды (ФОС), резистентный крахмал — способствуют росту сопутствующих анаэробов и создают благоприятную среду.
  • Продукты, богатые триптофаном: индейка, яйца, молочные продукты, семена тыквы, орехи, шоколад (в умеренных количествах).
  • Ограничить: сахар, ультраобработанную пищу, избыток простых углеводов — способствуют росту патогенов и дисбиозу.
  • Ферментированные продукты: кефир, квашеная капуста, комбуча — могут поддерживать общее разнообразие микробиоты, но не содержат A. putredinis.

Выращивание в домашних условиях

Alistipes putredinis — строгий анаэроб, требующий сложных условий культивирования. Домашнее выращивание невозможно без специального оборудования и стерильных условий.

  • Базовая питательная среда: бульон на основе казеина, дрожжевого экстракта, гемина и витамина K1 (аналог BHI с добавками для анаэробов).
  • Источники углеводов: глюкоза (0,5%), лактоза (не основной субстрат), инулин (1%) — для поддержки сопутствующей флоры.
  • Температурный режим: 37 °C, инкубация 48–72 часа.
  • Аэрация: строго анаэробные условия — требуется система восстановления (например, AnaeroGen) или работа в анаэростате.
  • Признаки ферментации: снижение pH до 6,2–6,5, отсутствие видимого роста (мутность минимальна), характерный запах (сероводород, гниль).
  • Меры стерильности: автоклавирование среды, работа в ламинарном боксе, использование стерильных пипеток и пробирок.
  • Хранение маточной культуры: только при −80 °C в глицерине (15–25%), пассирование — каждые 48 часов при комнатной температуре не допускается.

⚠️ Предупреждение: домашнее культивирование Alistipes putredinis нецелесообразно и опасно. Высок риск контаминации патогенами, неправильной идентификации штамма и развития инфекций. Для терапевтических целей предпочтительны сертифицированные препараты, если они будут разработаны.

Сохранение эффекта после отмены

Исследования показывают, что Alistipes putredinis — транзиторный представитель микробиоты. Он не колонизирует кишечник надолго без постоянного поступления.

  • После прекращения приёма (в экспериментах на животных) уровень штамма снижается до исходного за 1–2 недели.
  • Изменения микробиоты и метаболома могут сохраняться дольше, особенно при длительном приёме и сочетании с диетой.
  • Стратегии закрепления: длительные курсы (3–6 месяцев), периодический приём (раз в 1–2 месяца), изменение рациона (увеличение клетчатки и триптофана).
  • Постоянный приём может потребоваться при хронических состояниях, но безопасность длительной экспозиции не изучена.

Долгосрочная безопасность

Данных о многолетнем применении A. putredinis нет. Учитывая его принадлежность к грамотрицательным бактериям, существует теоретический риск:

  • Горизонтального переноса генов: возможен перенос генов устойчивости к антибиотикам (например, к метронидазолу), хотя у штамма ATCC 25870 не выявлено плазмид.
  • Системного воспаления: при транслокации (проникновении в кровь) может вызывать сепсис — описаны редкие случаи бактериемии у иммунокомпрометированных пациентов.
  • Рекомендации по мониторингу: при будущем применении — контроль маркеров воспаления, функции печени и почек, микробиом-анализ для оценки стабильности.

Заключение

Alistipes putredinis — перспективный, но спорный кандидат в следующее поколение пробиотиков. Относясь к строгим анаэробам и грамотрицательным бактериям, он действует в основном через метаболиты — индолы и КЦЖК — модулируя воспаление, барьерную функцию и нейротрансмиссию. Однако его роль в микробиоме двойственна: ассоциируется как с патологиями, так и с защитными эффектами.

На сегодняшний день A. putredinis не является доступным пробиотиком. Его применение ограничено исследованиями и ФГТ. В будущем он может войти в состав персонализированных пробиотиков для лечения ВЗК, метаболических и нейропсихиатрических расстройств. Однако требуется больше рандомизированных контролируемых исследований, стандартизация штаммов и оценка безопасности.

Рекомендуется обсудить с врачом любые попытки модуляции микробиоты, особенно при хронических заболеваниях. Самостоятельное применение штаммов, не одобренных регуляторными органами, не рекомендуется.