Микробиота кала (16S рРНК или shotgun-метагеномика)

Анализ микробиоты кала (16S рРНК или shotgun-метагеномика)

Зачем он нужен?

Этот тест оценивает состав и разнообразие кишечных бактерий, выявляя дисбаланс (дисбиоз), который связан с:
Пищеварением (СРК, вздутие, диарея/запор).
Иммунитетом (аутоиммунные болезни, аллергии).
Обменом веществ (ожирение, диабет).
Психическим здоровьем (депрессия, аутизм).
Синтезом витаминов (B12, K2, короткоцепочечные жирные кислоты).


Методы анализа

МетодЧто показываетТочность
16S рРНКОсновные группы бактерий (род/семейство)Доступный, но менее детальный
Shotgun-метагеномикаВсе микроорганизмы (включая вирусы, грибы, археи) + гены метаболизмаМаксимально точный

Симптомы дисбиоза

При дефиците полезных бактерий (лакто-, бифидобактерий):

  • Вздутие, запоры/диарея.
  • Пищевые непереносимости (лактоза, глютен).
  • Снижение иммунитета (частые простуды).
  • Дефицит витаминов (B12, D).

При избытке патогенов (клостридии, кандида, протеобактерии):

  • Хроническое воспаление (колит, болезнь Крона).
  • Аутоиммунные реакции (ревматоидный артрит).
  • Кожные проблемы (акне, экзема).
  • Тревожность, депрессия.

Нормы в анализах

Конкретных «норм» нет, но оценивают:

  1. Разнообразие (индекс Шеннона) – оптимально >3.5.
  2. Соотношение бактерий:
  • Фирмикуты/Бактероиды (F/B ratio) – в норме ~1.5.
  • Полезные бактерии:
    • Лактобактерии>1%.
    • Бифидобактерии>5%.
  • Патогены:
    • Клостридии<0.1%.
    • Кандида<0.01%.

Пример отчета (shotgun-метагеномика):

- Разнообразие: 4.2 (норма)  
- Бактероиды: 40% (норма 20–60%)  
- Фирмикуты: 45% (норма 30–50%)  
- Akkermansia muciniphila: 2% (норма >1%)  
- Escherichia coli: 0.5% (порог <1%)  

Что делать при дисбиозе?

1. Коррекция питания:

  • Пребиотики: цикорий, чеснок, бананы (питание для бактерий).
  • Пробиотики: кефир, квашеная капуста (Lactobacillus rhamnosus GG).
  • Исключение сахара/фастфуда (кормят патогены).

2. Добавки (по назначению врача):

  • Пробиотики (например, Saccharomyces boulardii при диарее).
  • Постбиотики (бутират для восстановления слизистой).

3. Антимикробная терапия (при избытке патогенов):

  • Натуральные: берберин, масло орегано.
  • Фармакологические: рифаксимин (при СИБР).

Когда назначают анализ?

  • Хронические проблемы с ЖКТ (СРК, запоры).
  • Аутоиммунные заболевания (целиакия, псориаз).
  • Ожирение/диабет (связь с метаболизмом).
  • Депрессия, аутизм (ось «кишечник-мозг»).

Вывод

🔬 Анализ микробиоты – ключ к пониманию причин многих хронических болезней.
📉 Дисбиоз бывает при дефиците полезных бактерий или избытке патогенов.
📊 Нормы:

  • Разнообразие >3.5.
  • Бактероиды/Фирмикуты ≈ 1.5.
  • Лакто-/Бифидобактерии >1–5%.
    💊 Лечение: диета, пробиотики, антимикробные средства.